牛津大学发表数据证实外显子/全基因组测序对颅缝早闭的遗传诊断价值
发表日期:2017-04-12 来源网站: 原文链接

导读

    牛津大学约翰瑞德克里夫医院对40个经核型或者微阵列基因组杂交技术未检出异常的颅缝早闭患者进行了外显子或者全基因组测序,在15例患者中发现可能与该病相关的突变(37.5%),涉及14个不同的基因。其中5例的分子诊断结果可直接用于医学干预指导。证实了外显子或者全基因组测序在探明这类疾病的致病突变方面的应用价值。结果发表在2017年的 J Med Genet。

摘要

背景介绍

对于一些疑似单基因病的患者,准确的分子诊断对于临床干预、咨询以及预后判断十分关键,尤其是对那些早诊断能帮助临床医生或者患者家庭做决策的病例。

颅缝早闭是指一个或者多个颅缝在成熟前发生闭合,其在出生人口中的发病率约为1:2250,可能为散发或者因综合征导致。其致病基因至少有57个,但常规实验室检测只包括其中少数基因。

方法

我们采用外显子或者全基因组测序对40例颅缝早闭患者进行检测以探讨其遗传病因,这些病例经核型或者微阵列基因组杂交技术未检出异常。

结果

我们在15例患者中检出可能与该病相关的突变(37.5%),包括14个不同的基因。除了IL11RA(2个家庭),其它基因突变仅在单个家族中出现。两个家族中发现的可能致病的2个新基因正在进行功能验证。我们将检出的13个已验证的突变分为以下几类:常见的会导致非典型表型的颅缝早闭基因突变(EFNB1与TWIST1)、其它的颅缝早闭核心基因(CDC45、MSX2以及 ZIC1)、突变极少会导致颅缝早闭的基因(FBN1、 HUWE1、KRAS以及STAT3)、已知是致病基因但与颅缝早闭的相关性未知的基因(AHDC1与 NTRK2)。另有在这15个诊断阳性病例中,5个病例的分子诊断结果可直接指导遗传学或者医学干预,分别为EFNB1,FBN1,KRAS,NTRK2以及 STAT3基因上发生的突变。

结论

颅缝早闭的遗传异质性以及多个可干预治疗的突变的检出证明了外显子或者全基因组测序在探明这类疾病的致病突变方面的应用价值。


原文见:Miller KA, Twigg SRF, McGowan SJ, et al.  Diagnostic value of exome and whole genome. J Med Genet 2017;54:260–268.


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